蚩尤生性残暴，与黄帝大战之前要扫除周围与自己为敌的小部落，所有不恭敬的臣服者和叛逆者都被蚩尤斩杀，在他眼里要么完全听从指挥，要么完全斩杀，他深信一旦打仗就会有仇恨，而被消亡的部落残留的未亡人内心会有叛逆的血液在流淌，即使暂时的卑躬屈膝，一旦那血液像毒蛇一样从骨子里探出头，那危险和厄运就会降临在自己头上，他的选择是宁可杀错，不可放过。
于此同时黄帝却刚刚相反，虽然也在征战，但他放下了手里的屠刀，凡是归属于他的都会编制到自己的军队，并给予异部族等同的待遇，并协助小部落生产，很多小的部族都心甘情愿臣服于黄帝，愿与黄帝并肩作战，数年以后，蚩尤和黄帝的大战开始了，黄帝认为仁者无敌，得人心者大。
交战前夕，神荼在庐山脚下发现了铜矿，他们使用铜制成了刀枪剑戟，军威大振，横扫周边小部落，加上上古大神夸父、刑天、共工的加入更是如虎添翼，自信满满的蚩尤气势汹汹的向黄帝发起挑战，黄帝生性爱民不想与蚩尤战斗，一直想和蚩尤休战，因为他知道这场大战无论谁主沉浮，最终是臣民的灾难。可是，蚩尤偏偏要一战高下，成为东方天空的霸主，他就每天派小股军队，侵犯黄帝的边境，蚕食边境小部落，并不断深入，黄帝对部下叹息道：
“我与蚩尤大战不可避免，我若战败，我的臣民会被无情的斩杀。我若姑息蚩尤，那就是养虎为患，等老虎强壮了也一定会吞噬我的华夏，他不行仁义，我只能惩罚不义，捍卫华夏，捍卫臣民，与之一战。”最终蚩尤轩辕大战起，谁主沉浮未可知，命运分离师游走在天地之间，见证了刚刚发生的一切。
黄帝先派应龙出战，这就是后来四海龙王的老大，他腹内有四海之水，更能飞天入海。应龙飞天，将四海之水，居高临下的向蚩尤阵中喷水，刹那间，大水汹涌，波涛如怒，气势如虹一样的奔向蚩尤，洪水如虎从天降，淹没无数村庄，害的蚩尤大军乱了阵脚，军队陷入一片骚乱。
蚩尤忙用风伯雨神上阵，一个刮起狂风，大树都被连根拔起，巨石像尘埃一样的吹起，风声水声怒号声，声声不息；一个把龙王喷出的水收集起来，龙王的水像是听话的小孩子走进雨神的容器里。反过来，两人又各显神威，刮风下雨，狂风暴雨竟然从蚩尤这边转弯，回到了黄帝阵营，那时应龙还不能收水，投身水中化为舟，营救众人水上游，只是人多己身小，载不动许多人，满是忧愁。
黄帝面临着灭顶的水灾，一时不知所措，就在众人将要被大水淹没的时候，一个光着脚的大胖子一脚踩出一道长河，把四海之水还于四海，从此这个巨人有一个响亮的名字叫赤脚大仙，可是此人不好战，没有加入任何一个阵营，只是为了苍生，人称“世外高人”，大水退去，赤脚大仙随风而去。
这是黄帝与蚩尤的第一次交锋，黄帝战败退去，可是，不久黄帝又重振旗鼓，虽然频繁的交战中败多胜少，可是黄帝的仁义之心已经远扬天下，所谓自古雄才多磨难，纨绔子弟少伟男，若是霸业轻易成，天道无情终不久。
长期的交战使得民不聊生，土地荒芜，人烟稀少，东方一片荒芜，黄帝觉得疲惫了，他想尽快结束这场战争，他苦苦思索战胜蚩尤的办法，始终都想不出来，疲倦让他昏昏欲睡，梦里的黄帝骑着一条巨龙在云雾中若隐若现的飞着，神龙把他带到女娲炼石补天处遇到了九天玄女，玄女送给黄帝一本兵书说：“按兵书行事，必克敌”，而后飘然而逝。
黄帝醒来，发现手里握着一本《阳符经》，内心大喜，迅速打开，书上只有八个字：“天一在前，太乙在后。”黄帝闭目思考，刚好看见早上太阳和月亮一起挂在天边，恍然大悟，于是按兵书所云，设九阵，置八门，阵内布置三奇六仪，置阴阳二遁，演绎变化，成为已经失传的：“天一遁甲阵。”
黄帝不断训练自己的兵士，决定与蚩尤决战。为了鼓舞士气，他听说东海有座山，山里住着一个兽，这兽能发出雷一样的巨响。这山叫流波山，这兽叫夔牛，因为夔牛不断作恶，黄帝派人把夔牛捉了回来，黄帝用夔牛皮做了一个鼓，可是敲鼓的棒槌总是达不到理想的效果，这时祝融对黄帝说：“雷泽有雷兽，专吃过往的行人，雷兽之骨蕴含天地灵气，何不替天行道取其骨。”
黄帝派祝融把雷兽捉来，杀之取其骨为擂鼓的棒槌，传说，这夔牛皮鼓敲一敲，能响五百里，连敲几下，能声震千里之外，黄帝得此鼓，军心大振，又用普通的牛皮做了80面鼓，那战鼓一响，天地震动，大海潮起掀起滚滚巨浪，甚至海里的鱼都吓的一动不动。为了彻底打败蚩尤，黄帝招来自己的女儿女魃前来助阵，大战就这样开始了。
夸父与与女魃战与逐鹿之野，双方在地上大战几百回合，女魃不敌夸父，便飞身上天，燃烧内心的小宇宙，身体发出炽热的火焰像太阳一样，从地面看去像赤红的火球。夸父使出法术使身高不断增加，挥舞着桃木杖追赶女魃。
女魃不断散发出热量，夸父觉得口渴，越来越渴，喝干了黄河之水，可是还是追不上女魃，口渴越来越厉害，他又喝干了渭河的水，最后想去雁门关喝大泽的水，只是半路渴死了，直至身体被烈火蒸干。夸父就这样死去了，黄帝的后人嘲笑夸父是一个疯子，历史上第一个精神病患者，最终太阳下落的地方成了夸父的坟墓，大神的桃木杖变成一片桃林，后来成了蟠桃园，夸父逐日终不悔，化身桃林为后人。
而南野黄帝率军袭击蚩尤的部队，水神共工携带魑魅魍魉前去迎战，一人独挡黄帝手下火神祝融，善畜牧骑射的力牧、鸟兽人身的句芒、还有英招，所向披靡，黄帝被打的节节败退。
这时命运分离师来到女娲娘娘身边说：“仁义与残暴，你应该有所选择啊！”
于是，女娲在不周山设坛把天封印起来，使蚩尤的军队进退不能，而黄帝得以休养生息，眼看胜利的果实就在眼前，却被女娲封天，共工大怒，对着天空大怒：“天道不公！”说完，一头撞向不周山，鲜血打破了女娲的封天，而大神共工就这样死去，九黎族的军队从封印里挣脱出来，继续和黄帝的军队作战。
战神刑天目睹了一切，心生怒气：“杀我炎帝，又害死我朋友。黄帝，我和你没完，一定用你的头颅祭亡灵。”说完拿起巨斧冲杀出去，一路杀过去，无人能战胜刑天，死在刑天巨斧下不知道有多少人，最后刑天杀到黄帝的大本营，对黄帝说：“黄帝不仁，我今天要砍下你的头！”
黄帝坐在座位上说了一句谎言：“炎帝其实没有死，就在你后面。”
单纯的刑天信以为真，转身期望再一次看见自己昔日的主人，心里放松了警惕，而黄帝趁其不备，用一把利刃砍下了刑天的头，可怪事发生了。刑天虽然人头落地，却不泯志，依然威武的站着。他用肚脐眼为眼睛，拿起操盾牌，挥舞巨斧向黄帝杀过去，似乎还要一决雌雄。
黄帝目瞪口呆，不知所措，这时大神青衣来到刑天身边悄悄说了一句：“炎帝已死，大忠会誓死相随，不侍二主！炎帝生性爱民，若见你与蚩尤为伍，定死不瞑目。”说完，刑天倒地，被黄帝安葬于常阳山麓，并封为“战神。”一代战神本不死，刑天倒地天地泣，天空下起了大雨。
蚩尤见形势不妙，率领自己的八十一个兄弟与黄帝大战，双方打的不可开交，他张开大口，喷出浓浓黑雾，三天三夜不散，黄帝的士兵找不到方向，被动的被蚩尤斩杀，刀枪剑戟厮杀的血腥味弥漫荒野，大地上血流成河，横尸遍野，可是黄帝的军队没有一丝后退的意思，或许这就是黄帝的人格魅力吧。
黄帝看着天空的月亮，命令士兵用木头制造了带着薪草的战车，点燃火把，在迷雾里指向南方，这就是最早的指南车，找到了方向之后，黄帝擂鼓又杀了回来，并从两翼包围蚩尤，中间异军突起，“天一遁甲阵”给了蚩尤致命性的打击。蚩尤寡不敌众，被迫撤退。
不甘失败的蚩尤向风伯雨神求助，地面刮起劈山蹈海一样的狂风，大雨像瀑布一样的倾洒而下，大地一时波浪滔天，一片汪洋。
黄帝也施展法术，召唤自己的女儿女魃前来助阵。女魃相貌及其丑陋，眼睛长在头顶上，头发卷曲由无数小蛇组成，小蛇嗜血而生，全身白毛，所到之处，赤地千里，所有水汽都会被她蒸发，无论人或者神听到她的名字都会发抖。刹那间，云淡风轻，泥泞变成干涸，女魃加入了黄帝的队伍，黄帝开始大反击。
蚩尤和八十一个兄弟拼死一战，蚩尤和女魃在地上大战几天几夜分不出胜负，水中激战千百回，巨浪滔天，万里水波开去，难分伯仲。转身空战不停休，日升月落好几回，只见残阳分几瓣，难分输赢，最后在空中应龙联手女魃战胜了蚩尤，蚩尤被应龙击杀，葬于帝丘，而蚩尤的鲜血化成一面旗帜封天，而女魃和应龙再也无力回天，终生只能生活在人间。
至此，东方唯一的霸主黄帝统一了东方，各个部落尊称黄帝为：“天子”。黄帝命令力牧推算历法，由此得知未来的气候和节令，最早的让民众合理利用自然又要节制的人，百姓安居乐业，一片欣欣向荣，东方大地逐渐恢复了生机。
命运分离师来到帝丘召唤蚩尤的精魂，看见蚩尤冷峻的脸，犀利的眼，不甘失败的心，对他说：“你还是个孩子，希望有一天你会在爱河里学会游泳，学会拥抱这个世界，珍惜拥有，补偿亏欠。”说完，分离师将蚩尤的精魂变成一只小蚂蚁放在一片叶子上，把自己一半的善给予蚩尤，把蚩尤的一半恶留给自己。他说：“你会漂洋过海去西方，成为和我一样的命运分离师，而我将在东方世界，你会有一个薪的名字——普罗米修斯。”
而西方大战在即，宙斯和众兄弟准备和父亲殊死一战，西方的天空会不会被宙斯改写。。。。。
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